《日治臺灣醫療公衛五十年》蒐集、譯註日治臺灣醫療、衛生的重要史料及文獻，是研究日治臺灣醫療公衛史極其重要且必備的書。
本書共分三部分：第壹部，譯註日治時期臺灣醫療公衛參與者、見證者──堀內次雄、丸山芳登共同撰寫之〈臺灣醫事衛生年表〉，記述當時醫療、醫學教育、傳染病防治及公共衛生……等重要大事之經緯。第貳部，為丸山芳登《日治時期臺灣醫療公共衛生業績》之譯註，分序、人口、疾病、設施四大篇，詳細記載了日治臺灣的人口狀況、傳染病現況、醫學教育、醫療行政等的調查、統計成果，完整呈現當時醫療公衛之整體面貌。第參部，編者精心選譯了當時具關鍵意義的醫療、公共衛生的法規與文獻，是深入了解日治臺灣醫療公衛政策理念與想法的重要參考資料。