有關臺灣佛教近三百多年來（1662-2008）發展和變革的「通史性主題論述」，觀察論述近百年兩次，分別來自戰前的日本佛教，與戰後來自大陸漢傳佛教等傳統所造成的鉅大衝擊，並說明不同時期臺灣地區所面臨多次政權鼎革前後的佛教史變化，及新統治當局在官方宗教行政上所採取的不同措施，與來自佛教界自身的相對調適和轉型過程所出現的各情況。
為求掌握臺灣本土長期佛教發展歷史的各種面向，作者以學院派歷史學者所慣用的細緻歸納法，來透視臺灣地區的漢人，自明清時代移墾迄今為止的出家佛教制度，和在家佛教制度的長期互動史。此外，也嘗試運用近代文化人類學所主張的「深描」技巧，對有意義或具代表性的各本土佛教的教團及其重要佛教領導人物的經營事業手法，進行具體細節的歷史描繪和變革風貌的陳述。