《儒家思想與存有三態論》是林安梧教授繼《道家想與存有三態論》之後的另一力作。「存有三態論」包括「存有的根源」、「存有的開顯」和「存有的執定」，這三個層次共同構成了存在的完整圖景。 「存有的根源」是指存在本身，亦即本源之「道」。《易經》「一陰一陽之謂道」，《論語》「志於道」是也。它強調天地人我萬物，通而為一，原是「寂然不動」的。在這一層次，存在被視為一種無限的可能性和潛能，是所有現象和事物的本源。 「存有的開顯」指的是存在於具體事物和現象中的展現，這即是《論語》「據於德，依於仁」，《易經》「感而遂通」。這是從「境識俱泯」進到「境識俱顯」，在這一層次，存在通過人類的文化、社會和倫理實踐得以具體化，強調人與人之間的和諧與關愛。 「存有的執定」是指人類經由語言文字來論定其對象物，進而通過制度、規範和倫理來確立和維護這個世界，《易經》所謂「曲成萬物」是也。這或者可以理解為禮樂制度和倫理規範。然而，「存有的執定」雖通過制度與規範確立社會秩序，卻可能因過度制度化而異化，使人與存有的根源脫節，導致價值虛無化與現代性危機。為解決此問題，林安梧提出「存有的歸復」，強調人須回歸存有的源，通過「氣的感通」，重建與天地萬物的整體性連結。存有的歸復不僅具有療育功能，更能恢復存有的連續性，達到存有三態的動態平衡與和諧。 林安梧特別注重「場域性」，主張人在天地人互動的存有網絡中「參贊化育」，既繼承儒家「天人合德」、「一體之仁」的傳統，又融合道家「道法自然」與佛教「緣起性空」的思維。《儒家思想與存有三態論》一書強調了存在的多層次性和人類在其中的積極作用，也為生態及環境倫理提供了哲學基礎，解決當代社會價值虛無化的困境，被視為「後新儒學」的重要里程碑。